生物信息学应用教程

前言

第1章 绪论

1.1 生物信息学的概念及研究对象

1.2 生物信息学的研究内容

1.3 生物信息学的应用

本章小结

思考题

推荐阅读书目

第2章 生物信息学相关的生物学基础

2.1 核酸化学

2.1.1 概述

2.1.2 核酸的化学组成

2.1.3 核酸的分子结构

2.2 蛋白质化学

2.2.1 概述

2.2.2 蛋白质的化学组成

2.2.3 蛋白质的结构单位——氨基酸

2.2.4 蛋白质的结构

2.2.5 蛋白质的变性与复性

本章小结

思考题

推荐阅读书目

第3章 生物信息学数据库

3.1 生物信息数据库的发展简史

3.2 核酸序列数据库

3.2.1 GenBank数据库

3.2.2 EMBL数据库

3.2.3 DDBJ数据库

3.3 蛋白质序列数据库

3.3.1 PIR数据库

3.3.2 UniProt数据库

3.4 生物大分子结构数据库

3.4.1 PDB

3.4.2 MMDB

3.4.3 SWISS-MODEL

3.5 其他生物分子数据库

3.5.1 dbSNP

3.5.2 NONCODE

3.5.3 miRBase

3.5.4 Ensembl

3. 5.5 UCSC Genome Browser

3.5.6 ExPASy

本章小结

思考题

推荐阅读书目

第4章 数据库查询

4.1 NCBI数据库查询系统Entrez

4.1.1 NCBI简介

4.1.2 NCBI数据库

4.1.3 Entrez简介

4.1.4 Entrez查询

4.2 EBI数据库查询系统SRS

4.2.1 EBI简介

4.2.2 EBI数据库

4.2.3 SRS简介

4.2.4 SRS查询

本章小结

思考题

推荐阅读书目

第5章 序列比对与数据库相似性搜索

5.1 概述

5.1.1 序列比对的概念

……

第6章 DNA序列分析

第7章 蛋白质序列分析

第8章 生物信息学软件及其使用

第9章 文献信息检索

第10章 Endnote X4参考文献管理软件

参考文献

《高等院校生命科学类“十二五”规划教材：生物信息学应用教程》分为绪论、生物信息学相关的生物学基础、生物信息学数据库、数据库查询、序列比对与数据库相似性搜索、DNA序列分析、蛋白序列分析、生物信息学软件及使用、文献信息检索、Endnote X4参考文献管理软件11部分。编者根据自己的教学实践，以图文并茂的方式介绍相关内容，以期达到使学生能够了解和掌握一些较常用的生物信息资源和工具的目的。本书是一本简明且实用性较强的生物信息学教程，适合生物学相关的非生物信息专业的学生使用，也可为从事生物学及相关专业的教学、科研人员参考使用。