计算分子进化

第1部分分子进化建模

第1章核苷酸置换模型

第2章氨基酸和密码子置换模型

第2部分系统发育重建

第3章系统发育重建：概述

第4章最大似然法

第5章贝斯方法

第6章方法比较与树的检验

第3部分高级专题

第7章分子钟与物种分歧时间估计

第8章蛋白质的中性与适应性进化

第9章分子进化的计算机模拟

第10章展望

附录

参考文献

　　本书旨在为生物学研究者介绍分子进化领域的统计分析工具，着眼点放在对资料分析有重要价值的方法，使读者系统而深入地了解其全貌，避免分析数据时的“黑箱作业”。　　分子进化生物学是一门利用分子数据重建物种或基因间的进化关系并了解其进化过程与机制的学科，统计模型及算法则是分子进化研究中的主要方法论工具。　　本书包含核苷酸置换和氨基酸置换模型、系统发育重建的常规方法及最大似然法与贝斯推断法、分子钟检验与物种分歧时间估计、适应性进化检测以及分子进化模拟技术等章节，内容丰富，方法新颖，并辅以实例说明，可作为高年级本科生和研究生教材，也可供进化生物学、分子系统学、群体遗传学以及生物统计学和计算生物学等相关领域的研究人员阅读。【作者简介】　　杨子恒，1964年生于甘肃通渭，1984年毕业于甘肃农业大学，1992年获北京农业大学博士学位。曾在甘肃农业大学和北京农业大学畜牧系工作以及英美等国从事博士后研究。1997年起在伦敦大学学院(UniversityCollegeLondon)生物系任教(1997-2000年任讲师，2000-72001年任副教授，2001年后任教授)，2006年当选为英国皇家学会院士(FellowoftheRoyalSociety)。作为国际知名的统计进化生物学家，杨子恒博士一直致力于发展新的最大似然模型及计算机程序(PAML)，1993年起在国际学术刊物发表论文100余篇；学术兼职包括Genetics、MoIecularBiologyandEvolution、JournalofMolecularEvolution和SystematicBiology等刊物副主编。