基因表达分析手册

上卷

第1章基因表达的基本概念

1．1引言

1．2细胞内的转录与翻译

1．2．1概述

1．2．2转录

1．2．3翻译

1．2．4小结

1．3转录调控

1．3．1概述

1．3．2mRNA表达谱转录组(transcriptome)

1．3．3蛋白质表达谱蛋白质组(proteome)

1．3．4基因和蛋白质的相互作用互作组(interactome)

1．3．5转录装置与核心启动子

1．3．6调节启动子

1．3．7增强子

1．3．8基因座控制区

1．3．9基质附着区

1．3．10隔绝子

1．3．11RIDGE曾强的基因表达区

1．3．12增强子体

1．3．13染色质

1．3．14沉默子元件

1．3．15转录因子、阻遏因子和辅助阻遏因子

1．3．16表观遗传学

1．3．17概括和总结

1．4转录后调控

1．4．1概述

1．4．2RNA稳定性和降解的调控

1．4．3转录延伸的调控

1．4．4前体mRNA的差别／可变剪接

1．4．5反式RNA剪接

1．4．6mRNA转运的调控

1．4．7定向的细胞mRNA定位

1．4．8mRNA聚腺苷酸化的调控

1．4．9反式RNA

1．4．10RNA编辑

1．4．11小结

1．5蛋白质的翻译后修饰

1．5．1概述

1．5．2蛋白质的酶促剪切

1．5．3乙酰化

1．5．4(聚)异戊二烯基化

1．5．5甲基化

1．5．6硫酸化

1．5．7磷酸化

1．5．8泛素化

1．5．9糖基化

1．5．10小结

1．6mRNA与蛋白质表达的相关性

1．6．1概述

1．6．2mRNA水平和蛋白质的表达：相关性和差异性

1．6．3小结

1．7持家基因及内部和外部的标准

1．7．1什么是持家基因

1．7．2重要持家基因概述

1．7．3其他常用的持家基因

1．7．4新确定的维持基因

1．7．5定量方法

1．7．6小结

1．8不同基因表达技术的分类

1．8．1概述

1．8．2从单个基因到转录组

1．8．3分类的方法

1．8．4小结

1．9总结

1．10参考文献

第2章样品制备与辅助工具

第3章mRNA表达的分析方法

下卷

第4章mRNA表达的高通量分析方法

第5章蛋白质表达分析

第6章原位和体内的mRNA及蛋白质表达分析方法

第7章计算方法和生物信息学工具