生物信息学

第1章 生物信息学概述

1.1 背景与定义

1.1.1 生物学原始数据量的急剧扩增

1.1.2 名词“bioinformatics”的第一次出现

1.1.3 定义

1.2 研究内容

1.2.1 生物信息的存储与获取

1.2.2 序列比对

1.2.3 测序与拼接

1.2.4 基因预测

1.2.5 生物进化与系统发育分析

1.2.6 蛋白质结构预测

1.2.7 RNA结构预测

1.2.8 分子设计及药物设计

1.2.9 代谢网络分析

1.2.10 生物芯片

1.2.11 DNA计算

1.3 数据库、软件、科研教育机构

1.3.1 数据库

1.3.2 软件

1.3.3 科研教育机构

1.4 期刊与著作

1.4.1 期刊

1.4.2 著作

1.5 生物学、计算机技术与数学基础

1.5.1 生物学

1.5.2 计算机技术

1.5.3 数学

1.6 展望

1.6.1 研究内容的展望

1.6.2 应用领域的拓展

1.6.3 研究者的回报

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习题

参考文献

第2章　生物信息学的生物学基础

2.1　生物学研究的层次

2.1.1　宇宙生命的研究目录生物信息学

2.1.2　生物与环境的关系

2.1.3　生物种类

2.1.4　生理

2.1.5　细胞

2.1.6　生物分子

2.1.7　生物进化

2.2　分子生物学基础

2.2.1　核酸的结构

2.2.2　蛋白质的结构

2.2.3　DNA的复制

2.2.4　基因的转录

2.2.5　蛋白质的生物合成

2.3　人类基因组计划

2.3.1　目标与意义

2.3.2　资助

2.3.3　研究机构

2.3.4　研究方法

2.3.5　目前结果

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习题

参考文献

第3章　数据库与网络基础

3.1　数据库技术基础

3.1.1　数据库的基本概念

3.1.2　数据库的体系结构和数据独立性

3.1.3　关系数据库系统

3.1.4　生物数据处理常用的数据库系统

3.2　网络技术简介

3.2.1　网络基础知识

3.2.2　Internet及其应用

3.2.3　基于Web的数据库系统

3.2.4　基于网络的搜索引擎

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习题

参考文献

第4章 UNIX操作系统与计算机语言

第5章 算法与数学基础

第6章 序列比对

第7章 序列拼接

第8章 生物信息数据库的查询与搜索

第9章 生物进化与分子系统发育分析

第10章 基因预测与引物设计

第11章 蛋白质结构及其预测

第12章 RNA结构与预测

第13章 生物芯片

第14章 计算机辅助药物设计

第15章 生物分子网络与生物系统仿真

第16章 DNA计算

附表1 生物信息数据库

附表2 中国、美国、英国、加拿大、澳大利亚科研教育机构开设生物信息学专业的情况

汉英名词索引

英汉名词索引

生物信息学是一门新兴的交叉科学。本书共分16章，详细介绍了生物信息学的定义、研究内容、生物学基础、数据库网络基础、算法与数学基础以及其在序列拼接、基因预测、引物设计、生物进化与分子发育分析、蛋白质结构预测、RNA结构预测、生物芯片、计算机辅助药物设计、生物分子网络与生物系统仿真、DNA计算中的应用与发展状况等内容。本书结构清晰，系统完整，文笔流畅，既可作为高等院校相关专业师生的教材，也可作为该领域中研究、教学、软件开发等科研人员的参考用书。

生物信息学融合了生命科学、信息科学等21世纪多个朝阳学科，越来越深入影响科学研究与社会生活的多个方面。开设生物信息学课程有利于提高学生科研理念及科技产业化意识。本书主要介绍了生物信息学的定义、生物学基础、数据库网络基础、算法与数学基础以及其在序列拼接、基因预测、引物设计、生物进化与分子发育分析、蛋白质结构预测、RNA结构预测、生物芯片、计算机辅助药物设计等十六章内容。本书内容新颖，重点突出，详略得当，能理论联系实际，深入浅出，通俗易懂。