出版社:科学出版社
年代:2014
定价:148.0
与数据测量技术相比较,相应的数据分析技术比较滞后。一些经典的生物信息学问题(如蛋白质三维结构预测、真核生物基因的预测等)不能得到解决,许多生命科学中的奥秘问题不断涌现。这种情形的出现一方面还是在于许多重大的生命现象规律没有得到发现,另一方面是其中涉及到物理、化学、生物化学、数学与计算机科学多学科的综合发展,因此有很多的难度。在多学科综合发展中,数学的理论与方法起到十分重要的作用。就蛋白质而言,它们的结构有几百到几十万个原子组成,这些原子有通过各种不同类型的力发生相互作用,由此形成五花八门、千奇百怪的空间结构,这些空间结构有决定各种不同功能的实现。因此对它们的分析涉及许多数学理论与方法,如大规模空间质点系分析的几何理论、组合分析与随机分析理论等。如果把这些数学理论更全面、深入地与生物信息学结合是当今数学工作者所面临的重大而又困难的任务。
目录
第四部分蛋白质的空间形态分析
第 16章空间形态分析概论与数学预备知识 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .531
16.1蛋白质空间形态结构分析概述 531
16.1.1蛋白质空间形态结构分析的主要途径 531
16.1.2蛋白质空间结构的指标类型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .532
16.1.3蛋白质空间结构形态的实例分析 535
16.2形态分析的指标体系. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .536
16.2.1蛋白质形态描述的总体指标 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .536
16.2.2蛋白质内部与表面形态特征的指标 540
16.2.3蛋白质内部其他特征指标 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .541
16.3一些数学知识的补充与介绍 543
16.3.1集合与拓扑空间 543
16.3.2平面多边形与空间多面体 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .545
16.3.3空间质点系与多面体 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 547
16.3.4超图与晶格 548
第 17章蛋白质空间形态的相似性分析 552
17.1形态的相似性问题 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 552
17.1.1形态的相似性的几种不同的度量指标 552
17.1.2序列比对算法 554
17.2蛋白质空间形态的比对 556
17.2.1三角形拼接带参数序列的比对 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .557
17.2.2离散化的蛋白质序列比对 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .558
17.2.3对长度在 300 AA左右的蛋白质的总体相似性分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . .560
17.2.4内部结构的相似性的比对结果与分析 562
17.2.5长短蛋白质的比对与定位 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .567
17.3其他实例计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 569
17.3.1离散情形下的实例计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 569
17.3.2同源蛋白质族的实例比对计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .570
17.3.3其他同源蛋白质的实例比对计算 575
17.3.4连续情形下的实例计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 575第 18章空间质点系的深度理论 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .579
18.1深度的一般理论 579
18.1.1深度的几种不同定义 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 579
18.1.2 T-深度与 L-深度的定义与概念 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 580
18.1.3 T-深度计算的基本定理 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .582
18.1.4 T-深度的其他性质 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 583
18.2 L-深度与层次函数 584
18.2.1 L1-深度的性质与推广 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 584
18.2.2一些简单图形的 L1-深度 , L2-深度计算 586
18.2.3质点系中的层次函数的定义与性质 591
18.2.4密度分布的定义 593
18.3深度函数的计算结果与分析 595
18.3.1深度的计算结果 595
18.3.2 T-深度与 L1-深度的关系分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 596
18.3.3氨基酸深度的倾向性因子计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .597
18.3.4深度倾向性因子的其他分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .600
18.3.5氨基酸序列在蛋白质中的深度预测 603
18.3.6层次函数的计算分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 604
18.4利用 L-深度与密度分布对一些特殊形态的蛋白质作结构分析 606
18.4.1一些具有特殊形态蛋白质的数据结构 606
18.4.2图形文件与特征分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 609
18.4.3有关内部结构的计算分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .612
18.4.4利用分布密度来说明蛋白质的形态结构特征 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 614第 19章空间质点系形态分析的几种基本计算法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 620
19.1凸闭包与凸壳 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 620
19.1.1凸闭包与凸壳的计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 620
19.1.2凸壳的拼接计算 622
19.1.3对 PDB2D42蛋白质的初步分析 623
19.1.4边界三角形的拼接计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 626
19.1.5 1GVM蛋白质的计算 629
19.2小球滚动法 630
19.2.1空球的定义与分类 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 630
19.2.2空球网络结构图 633
19.2.3空球网络结构的实际计算问题 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .635
19.3多面体收缩法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 638
19.3.1多面体结构性质的补充性质 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .638
19.3.2多面体收缩法的原理与性质 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .640
19.3.3多面体的收缩算法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 641
19.3.4小球滚动法与多面体收缩法的图表示 642
19.4实例计算与分析 643
19.4.1对 2D42蛋白质的第一步小球滚动计算 643
19.4.2多面体收缩计算 646
19.4.3对 1GVM蛋白质的计算与分析 649
19.4.4空球网络结构图的分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 653
19.4.5空球网络结构图的结构分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .655
19.4.6其他实例计算 658
第 20章空间质点系的多面体拟合理论 660
20.1多面体的拟合问题 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 660
20.1.1多面体拟合的目的与要求 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .660
20.1.2多面体拟合的类型与条件 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .662
20.1.3多面体空间结构特征的分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .664
20.1.4多面体的拟合计算方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 666
20.2拟合多面体的凹凸结构性质的分析与讨论 668
20.2.1凹凸深度的指标定义与分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .668
20.2.2不同结构域的聚类计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 670
20.3拟合多面体的分解与组合分析法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .672
20.3.1空间质点系的分解与组合 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .672
20.3.2不同结构域的交叉重叠区 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .673
20.3.3对 2D42蛋白质的初步计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 674
20.3.4 2D42蛋白质的活动坐标系计算与分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 675
20.4对 2D42蛋白质结构域的多面体收缩计算. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .677
20.4.1多面体的收缩计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 677
20.4.2对 2D42蛋白质结构域的 T-深度切割计算 680
20.4.3对 1GVM蛋白质结构域的分解与组合计算 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 683
20.5拟合多面体的动力学分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 689
20.5.1蛋白质空间形态的动态分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .689
20.5.2蛋白质与空间分子的啮合问题 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .690
20.5.3靶点的动力学分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 691
第五部分若干应用问题
第 21章几种球蛋白与膜蛋白分析 695
21.1血红蛋白的结构与功能分析 695
21.1.1血红蛋白结构性质的回顾与补充 695
21.1.2血色素的构造 698
21.1.3血红蛋白的变异分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 699
21.1.4血红蛋白空间结构的数据与图形表示 701
21.2病毒概论. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .702
21.2.1病毒的分布、分类与研究 702
21.2.2病毒的结构形态与传播过程 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .703
21.3免疫系统与免疫球蛋白 705
21.3.1免疫机制的一般概念 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 705
21.3.2免疫球蛋白的空间结构 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 708
21.3.3免疫球蛋白的计算分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 709
21.3.4免疫球蛋白的结构与功能分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .716
21.4生物膜与膜蛋白 718
21.4.1生物膜概论 718
21.4.2几种典型的膜蛋白 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 719
21.4.3膜转运体 722
21.4.4对膜蛋白的一些实例分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .724第 22章流行病传播过程中基因突变的定量化分析 726
22.1基因突变定量化分析的一般理论 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .726
22.1.1流行病传播过程中的几个关键环节 726
22.1.2序列比对的一般理论与方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .728
22.1.3多重序列比对 731
22.1.4序列比对中的一些理论问题 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .734
22.2定量化分析的主要方法 737
22.2.1基因突变的类型分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 737
22.2.2系统树的构造与分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 738
22.2.3拓扑距离结构图的构造与分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .740
22.2.4拓扑距离结构图的正交分解理论 743
22.3 SARS病毒传播过程的分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 746
22.3.1 SARS病毒传播过程的概况 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 746
22.3.2 SARS病毒传播过程的分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 747 22.3.3正交分解理论的应用 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 748
22.4 HIV病毒传播的基因突变分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 751
22.4.1 HIV病毒传播的一些基本知识 752
22.4.2 HIV病毒的基因与蛋白质结构 753
22.4.3一个特殊的 HIV病毒传播过程的定量化分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 754
22.4.4拓扑网络结构图的说明与讨论 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .755第 23章神经网络系统与神经科学 757
23.1神经网络系统概述 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 757
23.1.1不同神经网络系统的研究内容与意义 757
23.1.2 ANNS的研究概述 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .758
23.1.3 NNS的构造与功能 760
23.1.4 HBNNS概述 762
23.2感知器 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 764
23.2.1感知器模型与它的学习算法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .764
23.2.2感知器模型的推广 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 767
23.2.3支持向量机 771
23.3 其他几种 ANNS 772 HNNS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 772
23.3.1
23.3.2 HNNS中的一些理论问题 774
23.3.3正向与反向的 HNNS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .776
23.3.4有关智能计算法的讨论与说明 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .778
23.3.5对 ANNS的评议 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 778
23.4对 BNNS的讨论 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 780
23.4.1神经元与神经胶质的细胞特性 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .780
23.4.2神经元与神经胶质的网络结构特征 783
23.4.3不同感觉所产生的信号类型与特征 785
23.4.4不同感觉所产生的信号的异同点 787
23.5神经科学的综合研究与应用 789
23.5.1对不同 NNS研究的意义 790
23.5.2感知器模型的推广 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 791
23.5.3关于 ANNS理论推广问题的探讨 794
23.5.4对神经科学发展与应用的探讨与展望 795
第 24章酶与酶动力学 798
24.1概论 798
24.1.1酶的发现与特性 798
24.1.2酶的命名分类 800
24.1.3酶学杂谈 803
24.2酶动力学. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .803
24.2.1酶的动力学分析原理 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 803
24.2.2酶的活力分析 805
24.2.3酶活力的微观分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 809
24.2.4酶的实例分析 810
24.2.5对 ATP酶的分析 812
24.3酶的应用与酶工程学概述 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 814
24.3.1酶的工业生产 814
24.3.2酶的应用 816
24.3.3酶在一些前沿科学研究中的应用 817第 25章若干热点问题的探讨 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 821
25.1生态的多样性与系统的平衡问题 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .821
25.1.1蛋白质结构类型的多样性 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .821
25.1.2从蛋白质的一级结构与空间结构看它的多样性 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 823
25.1.3蛋白质多样性与生态系统的平衡性问题 825
25.2生物能源. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .825
25.2.1能源问题概论 825
25.2.2生物能源概论 829
25.2.3对第三代生物能源的探讨 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .830
25.2.4发展第三代生物能源的其他问题 834
25.2.5从科学幻想到科学奇迹 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 835
25.3关于基因分子生物学的补充说明与介绍. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .836
25.3.1基因组与染色体的一般特性 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .836
25.3.2染色体与基因组的空间结构 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .839
25.3.3细胞的有丝分裂与 RNA的结构分析 842
25.3.4基因组序列中的动力学性质 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .844
25.3.5基因分子生物学中的疑难问题 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .846
25.4其他难点问题 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 848
25.4.1一些难点问题 848
25.4.2造成这些难点问题的生理因素 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .849
25.4.3对动力学因素的考虑 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 851
25.5结束语 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 853
第六部分附录
附录 A重要符号的说明 857
A.1不同类型符号的说明 857
A.1.1英文大、小写字母的表示 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .857
A.1.2希腊字母的表示 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .859
A.1.3有关 PDB数据库中英文字母的表示 860
A.2有关数学公式的表示 862
A.2.1随机变量的概率分布与特征数 862
A.2.2一些数学公式与符号 864
A.2.3空间多面体与图的记号 864
A.3尺度指标的数据与比较 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 865
A.3.1尺度指标概论 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .865
A.3.2一些典型的尺度指标 867
A.3.3其他综合尺度分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .869附录 B一些重要概念与结果的说明 873
B.1生物信息学与信息动力学 873
B.1.1生物信息学 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 873
B.1.2 ID的理论与方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .874
B.1.3 ID与蛋白质一级结构的语义分析 875
B.2一些数学理论、方法与工具 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .876
B.2.1图论与拓扑空间 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .876
B.2.2凸闭包与空间多面体 878
B.2.3分子结构的几何分析 879
B.2.4分子结构的统计分析 880
B.3氨基酸与蛋白质的空间结构 881
B.3.1氨基酸的空间结构与蛋白质的三维结构表示 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .881
B.3.2蛋白质三维结构研究中的一些主要结论 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 883
B.3.3蛋白质的空间结构形态 885
B.3.4蛋白质的空间结构形态的分析方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 886
B.4分子动力学理论的分析与讨论 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 888
B.4.1蛋白质的形成过程与溶液中的动力学问题 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .888
B.4.2蛋白质内部的自由能 890
B.4.3蛋白质内部的结合能 891
B.5一些应用问题的说明 892
B.5.1一些重要蛋白质的分析 892
B.5.2一些特殊问题的讨论与分析 895
B.5.3酶与酶动力学 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 899
B.5.4有关热点问题的讨论 905
B.5.5基因分子生物学的补充说明与介绍 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 907附录 C有关数据库与光盘的说明 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 911
C.1关于数据库与数据处理中的一些说明. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .911
C.1.1关于数据库与数据处理中的一些问题 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 911
C.2光盘文件的说明 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 912
C.2.1 DATA0文件包 912
C.2.2 DATA1与 DATA2文件包 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 913
C.3光盘中所有文件一览表 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 914参考文献 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .921索引 934
自生物信息学诞生以来, 生物、医学与医药的研究已开始进入定量化的阶段. 大量生物信息数据的测定为此提供了基础与条件. 《蛋白质分析与数学:生物、医学与医药卫生中的定量化研究.下册》运用多种数学理论与方法, 对其中的问题进行研究, 寻找其中的规律、特征与应用
《蛋白质分析与数学:生物、医学与医药卫生中的定量化研究.下册》分上、下两册, 由六部分共25 章和3 个附录组成. 其中第一部分内容是预备知识与蛋白质一级结构分析, 对一些不同学科的知识进行综合性的介绍, 同时把蛋白质一级结构数据库看做蛋白质语言的文库, 由此对它作相应的语法与语义分析
第二、四部分内容是对蛋白质作空间结构分析, 把蛋白质空间结构分为三维结构与空间形态结构两部分内容. 其中前者是按共价键连接关系所产生的空间结构, 而后者是蛋白质的空间形态特征. 因此讨论它们的目标相同,但采用的数学理论、方法与模型不同
第三部分内容是蛋白质结构中的动力学分析, 其中包括分子动力学与信息动力学, 动力学问题是研究蛋白质结构与功能的关键, 利用这些讨论可对蛋白质分析中的许多重要问题有更深入的了解
第五部分内容是应用部分. 在此对一些重要的蛋白质作具体的结构与功能分析, 并对一些应用热点与难点问题进行讨论
第六部分内容是附录. 对《蛋白质分析与数学:生物、医学与医药卫生中的定量化研究.下册》所涉及的记号、公式作统一的表达, 并对一些重要概念与结论作概要说明. 《蛋白质分析与数学:生物、医学与医药卫生中的定量化研究.下册》涉及大量生物信息数据, 其中许多计算结果与彩色图像在光盘(见下册)中给出, 也可登陆www.sciencep.com 的下载区下载.
书籍详细信息 | |||
书名 | 蛋白质分析与数学站内查询相似图书 | ||
丛书名 | 生物数学丛书 | ||
9787030408785 如需购买下载《蛋白质分析与数学》pdf扫描版电子书或查询更多相关信息,请直接复制isbn,搜索即可全网搜索该ISBN | |||
出版地 | 北京 | 出版单位 | 科学出版社 |
版次 | 1版 | 印次 | 1 |
定价(元) | 148.0 | 语种 | 简体中文 |
尺寸 | 24 × 17 | 装帧 | 精装 |
页数 | 400 | 印数 |
蛋白质分析与数学是科学出版社于2014.6出版的中图分类号为 Q-332 ,Q51 的主题关于 生物数学-应用-蛋白质-分析-研究 的书籍。