基于k词的生物序列分析与预测的模型研究及应用

书籍简介:

本书以k词为研究对象，提出了一些DNA序列分析的非比对模型，主要成果有： （1）建立了DNA序列的一个新的几何图形表示模型。此模型是以有序的双核苷酸（2词）为研究对象，将一条DNA序列映射成一条3D曲线。运用此模型对DNA序列进行了突变分析，相似性分析和进化分析。在相似性分析和进化分析中，提出了一种简单有效的新的数值刻画量表征DNA序列，通过重构11个物种的进化树以及跟其它方法的比较，此模型蕴含着更为丰富的生物信息。此模型是对已有的几何图形表示模型的一种有效的补充。（2）将伪氨基酸方法的思想推广到DNA序列分析中，构建了一个新的模型。此模型仍然是以双核苷酸为研究对象，将伪氨基酸中20个氨基酸的频率换为16个双核苷酸的频率，并从16个双核苷酸中挑选了8个重要的双核苷酸，将它们的逻辑序列的复杂度作为组成成分构建了一个24维的特征向量。用欧式距离度量得到相似性矩阵，并用PHYLIP软件重新构建两组实验数据的进化树来说明此模型的有效性。（3）构建了DNA序列的一个概率模型。对DNA序列中的 词定义了一个新的概率分布，此概率分布不仅考虑了 词频率同时考虑了其位置信息。

书籍规格:

书籍信息归属:

基于k词的生物序列分析与预测的模型研究及应用是中国财政经济出版社于2019.5出版的中图分类号为 Q5 的主题关于 生物化学－序列－生物分析－生物模型－研究 ,生物化学－序列－预测－研究 的书籍。