林木遗传模型统计分析及R语言实现

前言1　固定效应模型和随机效应模型　1.1　固定效应模型　　1.1.1　模型表达式　　1.1.2　无约束模型的参数估计　　1.1.3　约束模型的参数估计　1.2　随机效应模型　　1.2.1　方差分量估计　　1.2.2　方差分量的假设检验　1.3　R语言程序　　1.3.1　无约束固定效应模型计算程序　　1.3.2　约束固定效应模型计算程序　　1.3.3　遗机效应模型计算程序　思考与练习2　半同胞子代测定遗传模型　2.1　单点多株小区试验统计模型　　2.1.1　一般配合力　　2.1.2　遗传方差估计与假设检验　　2.1.3　遗传力　　2.1.4　遗传相关系数　2.2　多点多株小区试验统计模型　　2.2.1　一般配合力　　2.2.2　遗传方差估计与假设检验　　2.2.3　遗传力　　2.2.4　遗传相关系数　2.3　实例分析及其R语言计算程序　　2.3.1　单点多株小区试验实例　　2.3.2　多点多株小区试验实例　思考与练习3　巢式设计遗传模型　3.1　包含区组和重复的巢式设计统计模型　　3.1.1　固定效应模型　　3.1.2　随机效应模型　　3.1.3　遗传力　　3.1.4　遗传相关系数　3.2　包含区组但不含重复的巢式设计统计模型　　3.2.1　固定效应模型　　3.2.2　随机效应模型　　3.2.3　遗传力　　3.2.4　遗传相关系数　3.3　不包含区组和重复的巢式设计统计模型　3.4　实例及R语言计算程序　　3.4.1　包含区组和重复的巢式设计实例　　3.4.2　包含区组但不包含重复的巢式设计实例　思考与练习4　因子交配设计遗传模型　4.1　多地点多区组因子交配设计统计模型　　4.1.1　固定效应模型　　4.1.2　随机效应模型　　4.1.3　遗传力　　4.1.4　遗传相关系数　4.2　单地点多区组因子交配设计统计模型　　4.2.1　固定效应模型　　4.2.2　随机效应模型　　4.2.3　遗传力　　4.2.4　遗传相关系数　4.3　单地点不含区组因子交配设计统计模型　4.4　实例及R语言计算程序　　4.4.1　多地点多区组因子交配设计实例　　4.4.2　单地点多区组因子交配设计实例　思考与练习5　双列杂交设计遗传模型　5.1　半双列杂交遗传模型　　5.1.1　固定效应模型　　5.1.2　随机效应模型　　5.1.3　遗传力　　5.1.4　遗传相关系数　5.2　全双列杂交遗传模型　　5.2.1　固定效应模型　　5.2.2　随机效应模型　　5.2.3　遗传力　　5.2.4　遗传相关系数　5.3　多地点半双列杂交遗传模型　　5.3.1　固定效应模型　　5.3.2　随机效应模型　　5.3.3　遗传力　　5.3.4　遗传相关系数　5.4　多地点全双列杂交遗传模型　　5.4.1　固定效应模型　　5.4.2　随机效应模型　　5.4.3　遗传力　　5.4.4　遗传相关系数　5.5　实例及R语言计算程序　　5.5.1　半双列杂交设计实例　　5.5.2　全双列杂交设计实例　　5.5.3　多地点全双列杂交设计实例　思考与练习6　多地点多年份家系试验遗传模型　6.1　多地点家系试验统计模型　　6.1.1　固定效应模型　　6.1.2　随机效应模型　　6.1.3　遗传相关系数　6.2　多年份家系试验统计模型　　6.2.1　固定效应模型　　6.2.2　随机效应模型　　6.2.3　遗传相关系数　6.3　多地点多年份家系试验统计模型　　6.3.1　固定效应模型　　6.3.2　随机效应模型　　6.3.3　遗传相关系数　6.4　实例及R语言计算程序　　6.4.1　多地点家系试验实例　　6.4.2　多年份家系试验实例　　6.4.3　多地点多年份家系试验实例　思考与练习7　方差分量约束极大似然估计　7.1　ML估计　7.2　REML估计　7.3　实例及R语言计算程序　思考与练习8　育种值的最佳线性无偏预测　8.1　混合模型方程　8.2　动物模型　8.3　多地点半同胞子代测定试验育种值计算　思考与练习参考文献附录A　矩阵基本概念和运算　A1　矩阵的定义　A2　矩阵的运算　A3　矩阵的分块运算　A4　特征值和特征向量　A5　正定矩阵和半正定矩阵　思考与练习附录B　林木遗传模型统计分析软件　B1　半同胞子代测定遗传模型分析软件HalfsibSS　B2　巢氏设计遗传模型分析软件WinNCl　B3　因子交配设计遗传模型分析软件WinNC2　B4　双列杂交设计配合力分析软件GSCA附录C　R语言简介　C1　R语言软件下载与安装　C2　R语言工作窗口　C3　R语言矩阵运算符和控制语句

童春发、施季森编著的这本《林木遗传模型统计分析及R语言实现》的宗旨是让读者学会以现代线性模型的理论来建立林木遗传统计分析模型，理解在平衡试验数据条件下以及在不平衡试验数据条件下遗传参数估计和假设检验的基本计算方法，并在此基础上可以更好地正确使用SAS或AsReml等统计计算软件，必要时可以使用高级计算机语言(如R语言等)编写程序计算一些重要的遗传参数。本书共有8章。童春发、施季森编著的这本《林木遗传模型统计分析及R语言实现》系统地阐述了多种林木遗传育种统计模型参数估计和假设检验的基本方法与应用。共分8章。第1章介绍固定效应模型和随机效应模型概念。第2章至第6章分别论述半同胞子代测定、巢式设计、因子交配设计、双列杂交设计和多地点多年份家系试验遗传模型分析方法。最后两章介绍方差分量约束极大似然估计和育种值的最佳线性无偏预测的混合模型方程方法。各章配有模拟试验数据和R语言计算程序。　　本书适合林木遗传育种专业研究生、教师和科技人员使用，也可供作物育种和动物育种领域里的研究人员和师生参考。