动物重要经济性状基因的分离与应用

第1章 绪论

参考文献

第2章 QTL连锁分析理论和方法

2.1 QTL连锁分析概述

2.2 Bayes统计推断的基本原理

2.3 基于RJ-MCMC进行畜禽远交群体QTL连锁分析

2.3.1 遗传模型

2.3.2 标记基因型和性状表型的数据模拟

2.3.3 QTL的IBD矩阵推断方法

2.3.4 基于RJ - MCMC的QTL连锁分析

2.3.5 连续性状QTL连锁分析

2.3.6 二级阂性状QTL连锁分析

2.3.7 主要结论

2.4 基于贝叶斯压缩（Bayes shrinkage）技术的QTL连锁分析

2.4.1 基于Bayes压缩技术的连锁分析模型

2.4.2 全条件后验分布推导和MCMC抽样

2.4.3 基于MCMC参数估计值的统计检验

2.4.4 贝叶斯压缩方法的模拟验证

参考文献

第3章 QTL精细定位理论与方法

3.1 基于IBD方法的基因精细定位

3.1.1 IBD定位方法基本原理

3.1.2 IBD精细定位的分析方法

3.1.3 IBD精细定位的模拟研究

3.2 结合连锁分析（LA）和连锁不平衡分析（LA/LD）的QTL精细定位策略

3.2.1LD/LA定位的理论基础和方法

3.2.2 基于模拟试验进行LA和LA/LD分析的比较研究

3.2.3 主要结论

参考文献

第4章 基于传递不平衡检验的关联分析方法

4.1 利用系谱传递不平衡检验进行阈性状QTL定位

4.1.1PTDT方法

4.1.2 PTDT的检验功效和工型错误

4.1.3 影响PTDT检验效力的因素

4.2 利用系谱传递不平衡检验进行数量性状QTL定位

4.2.1 数量性状转化为分类性状方法

4.2.2 选择性基因型测定

4.2.3 数据模拟

4.2.4 数量性状转化方法比较

4.2.5 PTDT与QTDT和PDT效力比较

4.2.6 PTDT选择性基因型测定基因定位效力

参考文献

第5章 单倍型推断

5.1 基本概念

5.1.1 单倍型（haplotype）、双倍型（diplotype）

5.1.2 单倍型推断

5.1.3 大片段染色体单倍型推断

5.2 利用单亲资料推断单倍型-SPFHAP法

5.2.1 方法概述

5.2.2 单倍型推断效放率

5.3 利用全同胞信息推断单倍型-FSHAP法

5.3.1 方法概述

5.3.2 单倍型推断效率

5.4 复杂家系单倍型推断

5.4.1 零重组单倍型推断方法（ZRHI）

5.4.2 有重组单倍型推断方法-MRHI

5.4.3 讨论

参考文献

第6章 生物信息学在重要经济性状的基因分离中应用

6.1 牛全基因组转录因子数据库构建

6.1.1 牛全基因组预测转录因子识别原理

6.1.2 数据与方法

……

第7章 动物分子标记辅助育种技术

第8章 基因组选择技术

第9章 猪免疫性状基因定位

第10章 仔猪腹泻抗性基因分离与鉴定

第11章 奶牛产奶性状全基因组关联分析

第12章 鸡生长和产蛋性状候选基因分析

第13章 动物杂种优势分子遗传机理研究

参考文献

《现代农业高新技术成果丛书：动物重要经济性状基因的分离与应用》总结了动物重要经济性状重要基因挖掘和利用方面国内外在理论、方法及应用上的研究进展，系统介绍了本研究团队取得的研究发现和重要成果。内容既涉及经典的复杂性状连锁分析、精细定位、候选基因分析、基因表达分析、标记辅助选择和生物信息学的理论与方法，又涵盖了近年来的研究热点：包括全基因组关联分析、基因组选择、基因聚合的理论与方法。同时《现代农业高新技术成果丛书：动物重要经济性状基因的分离与应用》阐述了上述理论方法在我国畜禽（包括奶牛、猪、鸡）分子育种和基因检测中的应用及主要结果。
《现代农业高新技术成果丛书：动物重要经济性状基因的分离与应用》可供高等院校、科研机构等从事动物遗传育种的科研人员和研究生参考。