免疫信息学原理及其应用

第1章绪论

1.1免疫信息学是一门新兴交叉学科

1.2免疫信息学研究的基本问题

1.3免疫信息学研究的基本方法

1.3.1数据库构建方法

1.3.2计算与统计学方法

1.3.3数学建模与计算机模拟方法

1.4免疫信息学的应用

1.4.1系统免疫学理论与人工智能研究

1.4.2疫苗研发与传染病研究

1.4.3实验与临床免疫学研究

参考文献

第2章免疫生物学基础

2.1免疫应答

2.1.1天然免疫

2.1.2适应性免疫

2.2免疫系统的组成与结构

2.2.1免疫器官

2.2.2免疫细胞

2.2.3免疫分子

2.3免疫系统的机制

2.3.1抗原

2.3.2免疫系统的特异性识别

2.3.3免疫记忆与免疫耐受

2.4免疫监督

2.5免疫效应及其调节机制

2.5.1免疫效应

2.5.2免疫调节

2.6免疫系统的复杂性特征

2.6.1复杂性适应系统

2.6.2免疫系统的自组织

2.6.3免疫系统网络

2.7小结

参考文献

第3章免疫系统功能模建

3.1淋巴细胞的免疫识别与增殖动力学

3.1.1T、B淋巴细胞受体库大小估计

3.1.2淋巴细胞增殖与分化的克隆模型

3.2独特型网络与免疫应答

3.2.1独特型网络与免疫记忆

3.2.2独特型网络与免疫耐受

3.3免疫系统的调节

3.3.1免疫相关细胞的分子调控网络

3.3.2免疫应答的细胞调节

3.3.3宿主免疫应答的系统水平的调节

3.4小结

参考文献

第4章免疫信息学数据库和数据挖掘

4.1数据库概念

4.2免疫信息学数据库

4.2.1简介

4.2.2基于网络的免疫信息学公共数据库利用

4.2.3免疫多态性数据库(IPD)

4.2.4SYFPEITHI

4.2.5IMTECH免疫信息学数据库

4.2.6抗原决定簇数据库(IEDB)

4.3数据挖掘与知识发现

4.3.1数据挖掘在免疫信息学中的作用

4.3.2数据挖掘在免疫信息学中的应用步骤

4.3.3短肽预测的数据挖掘实例

……

第5章B细胞表位的预测

第6章T细胞表位的预测

第7章抗原处理与TAP转运预测

第8章感染性疾病的传播动力学及免疫流行病学模型

第9章抗病毒疫苗研究

第10章反向疫苗学在抗细菌疫苗中的应用

第11章免疫信息学在抗原虫病疫苗研发中的应用

第12章抗蠕虫疫苗研发

第13章免疫信息学和抗肿瘤疫苗的研发

第14章生物信息学在抗自身免疫病疫苗研发中的应用

第15章免疫信息学在实验与临床免疫学中的应用

附录A

附录B

　　免疫信息学是一门新兴的交叉学科，有许多理论和技术问题仍有待相关领域的研究工作者深入探讨。　　本书内容包括免疫生物学基础、免疫系统功能模建、免疫信息学数据和数据挖掘、B细胞表位的预测、T细胞表位的预测、抗原处理与TAP转运预测、感染性疾病的传播动力学及免疫流行病学模型、抗病毒疫苗研发、反向疫苗学在细菌疫苗中的应用、免疫信息学在抗原虫病疫苗研发中的应用、抗蠕虫疫苗研发、免疫信息学和抗肿瘤疫苗的研发、生物信息学在抗自身免疫病疫苗研发中的应用、免疫信息学在实验与临床免疫学中的应用。　　本书内容包括免疫生物学基础、免疫系统功能模建、免疫信息学数据和数据挖掘、B细胞表位的预测、T细胞表位的预测、抗原处理与TAP转运预测、感染性疾病的传播动力学及免疫流行病学模型、抗病毒疫苗研发、反向疫苗学在细菌疫苗中的应用、免疫信息学在抗原虫病疫苗研发中的应用、抗蠕虫疫苗研发、免疫信息学和抗肿瘤疫苗的研发、生物信息学在抗自身免疫病疫苗研发中的应用、免疫信息学在实验与临床免疫学中的应用。