药物设计学

导论

第一节药物发现

一、药物发现的历史

二、药物发现的定义

三、药物发现的阶段

四、新药研发的社会科学

第二节药物设计

一、靶点和配体

二、药物作用的体内过程

三、先导物

四、合理药物设计

五、筛选途径

六、虚拟筛选

七、先导物优化及药物设计原理和方法

八、立体异构药物和外消旋转换

结语

第一章基于筛选途径的药物发现

第一节化合物的来源

一、天然产物的提取

二、通过组合化学合成的化合物

三、各研究机构库存化合物

第二节组合化学和化合物组合库

一、概述

二、固相组合合成

三、液相组合化学

第三节筛选模型和方法学

一、药物靶点的选择和确证

二、筛选模型和方法学

三、高通量筛选

四、高内涵筛选

结语

第二章基于靶点的药物设计

第一节药物发现的方法学

一、基于功能的途径

二、基于症状的途径

三、基于机制的途径

四、三种药物发现途径的特点比较

第二节药物靶点的发现和确证

一、药物靶点的内涵

二、确定药物靶点在新药研究中的意义

三、药物靶点研究的现状

四、药物靶点的发现途径

五、药物靶点发现的识别和确证过程

六、药物靶点研究的主要技术平台

第三节基于靶点的药物设计方法

一、基因性靶点及药物设计方法

二、机制性靶点及药物设计方法

第四节实例

一、治疗早老性痴呆药物的研究

二、抗消化性溃疡药物的研究

三、抗肿瘤靶点研究

结语

第三章基于性质的药物设计

第一节概述

第二节药物理化性质与其体内过程问的关系

一、药物在体内的ADME过程

二、药动学

第三节类药性及其测量方法

一、类药性

二、类药性的测量方法

第四节类药性预测方法

一、原始数据库的分析

二、简单的虚拟筛选方法

三、识别药物与非药物的计算方法

四、药动学性质预测方法

五、类药性预测方法的比较

第五节药动学优化

一、通过结构修饰改善化合物药动学性质

二、通过制剂方法改善药物药动学性质

结语

第四章基于结构的药物设计

第一节基本概念

一、受体理论和药物一受体相互作用

二、药物的结构与生物活性的关系

三、基于结构的药物设计的策略

四、计算机辅助药物设计

第二节计算机辅助药物设计的基本理论和技术

一、三维结构的理论计算方法

二、分子三维结构测定

三、分子模拟

四、计算机硬件和软件

第三节基于靶点结构的药物设计直接法

一、生长法

二、连接法

三、其他方法

第四节基于配体结构的药物设计间接法

一、药效基团模型法

二、基于配体相似性的虚拟筛选

三、二维定量构效关系

四、三维定量构效关系方法

结语

第五章药物发现的虚拟筛选方法

第一节概述

第二节化学信息处理

一、化学信息的表示方法

二、化合物数据库的生成和管理

三、分子相似性和多样性分析

四、互联网上的化学信息资源

第三节生物信息处理

一、序列分析

二、蛋白质结构预测

三、互联网上的生物信息资源

第四节虚拟筛选

一、基于靶点结构的虚拟筛选分子对接

二、基于配体相似性的虚拟筛选药效基团搜寻

三、虚拟筛选后评估

结语

第六章先导物的优化

第一节概述

一、模仿药物的概念

二、优化前提

三、优化原则

第二节前药原理

一、前药的基本原理

二、前药原理的应用

三、靶向药物设计

第三节生物电子等排原理

一、基础知识

二、经典生物电子等排体

三、非经典生物电子等排体的应用

第四节拼合原理

一、概述

二、应用实例

第五节软药设计

一、概述

二、软药设计方法

结语

第七章酶抑制剂和肽拟似物

第一节酶抑制剂

一、概述

二、酶抑制剂的特征

三、酶抑制剂的类型

四、设计原理和方法

第二节肽拟似物

一、概述

二、设计方法和原理

第三节设计实例

一、肾素和血管紧张素转化酶抑制剂

二、凝血酶抑制剂

三、HIV蛋白酶抑制剂

结语

书中常用缩略语

药物设计中常用数据库的网址、内容和说明

专业词汇汉英对照及索引

彩图

　　本书为普通高等教育“十一五”国家级规划教材。“药物设计学”是一门新兴学科，发展很快，本教材第2版中近2／3的内容是新增和修订的，但阐述的主线仍然是先导物衍生的两条途径筛选和合理药物设计（包括基于靶点、性质和结构的药物设计）以及与此相关的理论和方法，重点仍然是阐述化学小分子药物。书中各章后附有相关参考文献和阅读材料以及书末列出的教材中常用缩略语和具有实用价值的常用数据库网址，专业英语词汇及索引，供查阅和学习提高之用。文内黑体印刷的为重要专业术语，需掌握。本书编写过程中参考了国外MEWolff于1995年主编的BurgertsMedicinalChemistryandDrugDiscovery5thed．VolLlme1：PrinciplesantPractice，也可作为学生的主要参考书。　　本书为普通高等教育“十一五”国家级规划教材。　　“药物设计学”是一门新兴学科，发展很快，本教材第2版中近2／3的内容是新增和修订的，但阐述的主线仍然是先导物衍生的两条途径筛选和合理药物设计（包括基于靶点、性质和结构的药物设计）以及与此相关的理论和方法。本教材中基于靶点、基于性质的药物设计以及虚拟筛选方法的内容是适合新世纪药物发现的全新内容，属药物设计前沿领域，适合学生素质教育和创新思维培养。计算机辅助药物设计、先导物优化以及组合化学和高通量高内涵筛选，是关于药物设计的方法学研究，在介绍原理和技术的同时以巧妙运用的实例进行重点阐述。本教材取材新颖，重点突出，图文并茂，能满足教学需要。　　各章后附有相关参考文献和阅读材料以及书末列出的教材中常用缩略语和具有实用价值的常用数据库网址，专业英语词汇及索引，供查阅和学习提高之用。　　本教材可供药学类及相关专业本科生使用，也适合从事医药研究的专业人员参考。