遗传流行病学

第一章绪论

第一节遗传流行病学概述

一、遗传流行病学的概念

二、学科的形成与发展

三、我国遗传流行病学的发展简介

第二节研究对象和任务

第三节主要研究方法概述

一、家族聚集性研究

二、分离分析

三、连锁分析

四、关联分析

第四节研究进展简介

第二章遗传流行病学的基本概念和原理

第一节遗传学的基本概念

一、遗传物质

二、细胞的分裂活动

三、突变

第二节流行病学的基本概念和原理

一、流行病学中的重要概念

二、疾病频率的测量

三、流行病学研究的类型

四、关联的测量

五、流行病学中的偏倚

第三节遗传流行病学的基本概念和原理

一、孟德尔遗传

二、群体遗传学

第三章孟德尔式遗传的原理

第一节基本概念

一、家族性、散发、遗传性和拟表型

二、表型、基因型和外显率

三、显性、隐性、共显性及剂量依赖的加性作用

第二节单一位点的孟德尔式遗传

一、孟德尔式遗传定律

二、配子及子代基因型的确定

三、人群等位基因频率

第三节多位点的孟德尔遗传

一、复等位基因位点

二、两位点的孟德尔式遗传

三、家系谱图的绘制

第四节常染色体遗传病

一、常染色体显性遗传病

二、常染色体隐性遗传病

第五节伴性遗传

一、性染色体的遗传

二、以X连锁遗传病为例说明

第四章家族聚集性研究

第一节家族研究的基本概念

一、研究表型

二、遗传关系和基因同一性

三、家族危险性

四、疾病家族史

五、病例对照和队列研究的重叠

第二节家族研究的设计

一、一般原则

二、含家族组分的流行病学研究

三、以人群为参照的病例研究

四、固定亲属组

五、养子研究

六、家谱图

七、家族聚集性的随机化检验

第三节家族聚集性的测量指标

一、相对比和率差

二、家族史得分

三、家族危险性

四、亲属间疾病状况的独立性检验

第四节家族聚集性原因的识别

一、研究设计

二、分析方法

三、家族研究中协变量的校正

第五节连续表型的家系关联

第五章遗传度分析

第一节遗传度的概念

一、定义

二、用简单线性模型估计遗传度

第二节方差组分模型

一、遗传方差组分

二、环境方差组分

三、根据亲属资料估计方差组分

四、方差组分估计的一般性方法

五、方差组分模型的诠释

第三节通径分析

一、通径模型的构建

二、通径系数的估计

三、通径模型的诠释

第四节质量性状遗传度的估计

一、风险函数的含义

二、与方差组分模型的比较

三、与通径模型的比较

四、多因素模型对再发风险的估计

第六章分离分析

第一节分离分析的基本概念

第二节分离分析中家系的确证和收集

一、家系的确证

二、序贯抽样

第三节经典分离分析法

一、基本原理

二、确证校正和估计分离比

三、样本含量

四、关于确证校正的其他问题

第四节综合分离分析

一、定义基本参数

二、计算似然函数

三、确证校正

四、ClassD回归模型

五、选择最优模型

第五节分离分析的局限性

第七章连锁分析

第一节概述

一、连锁分析的概念和原理

二、连锁分析的过程

三、连锁分析的分类

第二节连锁分析的遗传学基础

一、减数分裂

二、重组和作图函数

三、血缘一致性和状态一致性

第三节连锁分析的方法

一、直接计数法

二、LOD值法

三、亲属对方法

四、连锁分析方法的选择

五、连锁分析研究设计相关的问题

第八章连锁不平衡定位

第一节连锁不平衡

一、连锁不平衡的定义

二、导致遗传标记物与致病基因间连锁不平衡的机制

三、连锁不平衡的度量

第二节连锁不平衡定位机制

一、连锁不平衡定位的基本思想

二、对连锁不平衡定位具有重要意义的两种机制

第三节连锁不平衡定位参数模型

一、评估致病基因的经验方法

二、单体型共享方法

三、基于合并的参数方法

四、在人类基因组中存在多少连锁不平衡

第四节单体型区块与连锁不平衡

一、单体型

二、单体型区块

三、单体型区块与连锁不平衡

第九章群体遗传学原理

第一节单个位点的基因分布

一、大群体中的Hardy-Weinberg平衡

二、Hardy-Weinberg平衡定律的应用

三、影响群体基因频率的因素

四、近婚系数

第二节两个位点的基因分布

一、连锁不平衡的起源

二、连锁不平衡的衰减

三、连锁不平衡的估计

第十章候选基因关联研究

第一节候选基因关联研究中的基本概念

一、易感基因与候选基因

二、关联和连锁不平衡

三、人群分层

四、表型和中间表型

五、关联研究中表示关联强度的指标

第二节候选基因关联研究的设计类型

一、队列研究设计

二、病例对照研究设计

三、以家庭为基础的关联分析

四、基因组关联分析

第三节候选基因关联研究中需要注意的问题

一、候选基因的选择

二、候选基因关联研究样本量的选择

三、基因分型与表型测量

四、关联研究结果的解释

第十一章交互作用分析

第一节基本概念与研究设计

一、交互作用的基本概念

二、主要的研究设计类型

第二节统计分析方法及应用

一、Logistic回归模型

二、多因子降维法

三、组合法

四、随机森林法

五、集合关联法

六、神经网络模型

第三节交互作用的研究前景

一、交互作用分析方法所面临的问题

二、分析方法的比较与进展

三、系统生物学的兴起

第十二章遗传流行病学在医学和公共卫生中的应用

第一节遗传流行病学在临床医学中的应用

一、疾病筛查和诊断试验评价

二、疾病异质性研究

三、疾病自然史研究

四、治疗效果和安全性评价

第二节遗传流行病学研究在疾病预防中的应用

一、疾病预防的策略

二、以家系为基础的预防

三、以人群为基础的预防

第三节遗传流行病学在公共卫生监测中的应用

第四节遗传流行病学研究中的伦理学问题

索引

　　本书共十二章，内容包括绪论、研究方法介绍和应用。第一章绪论介绍了遗传流行病学学科发展的简史、学科特点与发展趋势；从第二章到第十一章详细介绍了遗传流行病学的基本原理、各类常用的研究方法，如家族聚集性研究、遗传度分析、分离分析、连锁分析、连锁不平衡定位、群体遗传学、候选基因关联研究以及遗传交互作用分析；第十二章重点介绍了遗传流行病学在医学与公共卫生方面的应用。本书可作为遗传流行病学教学人员的参考用书，也可作为在校本科生与遗传流行病学专业研究生学习遗传流行病学的推荐读物，对从事相关领域研究的科研人员也具有一定的参考价值。