R软件及其环境流行病学应用

第一篇 R基础

第1章 绪论

1.1 R的起源和发展

1.2 R的功能和特点

1.3 R软件的获取与安装

1.4 R工作基本原理

1.5 R在线帮助

1.6 获取关于R和系统的信息

第2章 R的数据操作

2.1 数的简单运算

2.2 数学函数

2.3 向量

2.4 矩阵

2.5 数组

2.6 因子向量

2.7 随机序列

第3章 对象和数据框

3.1 对象的种类与属性

3.2 改变对象的属性

3.3 对象的使用

第4章 R数据的生成、导入和导出

4.1 创建R数据集

4.2 从文件读取数据

4.3 从其他应用软件所产生的数据文件导入数据

4.4 存储数据

4.5 在R中显示数据

第5章 数据集的整理

5.1 数据集的检查

5.2 数据集的修改

5.3 变量值的替换或取出数据子集

5.4 向量和矩阵的合并与删除

第6章 R程序包

6.1 R程序包的种类

6.2 程序包的安装

6.3 关于程序包操作的函数

6.4 程序包及其帮助

第7章 R函数

7.1 函数的调用与查询

7.2 用户自定义函数

7.3 几种特殊的函数

7.4 泛型函数

第8章 R绘图

8.1 管理绘图

8.2 绘制图形

8.3 绘图参数与绘图符号

8.4 几种复杂图形的绘制

第9章 控制流

9.1 if（）条件语句

9.2 ifelse（）函数

9.3 switch（）函数

9.4 for（）语句

9.5 while（）语句

9.6 repeat语句

第10章 R编程实践

10.1 一个非线性模型的编程

10.2 编写一个两独立样本t检验的R程序

10.3 独立样本2x2差异性检验的自定义函数

10.4 计算线性回归参数估计值的程序

10.5 对三个不同种属的鸟绘图

10.6 编写用Newton-Raphson迭代法求解非线性方程组的根的程序

10.7 用递归函数计算积分的程序

10.8 正态分布概率密度函数动画程序

10.9 一个猜数字的小游戏

10.10 程序的运行方式

第二篇 常用统计方法

第11章 定量变量的描述性统计

11.1 频数分布

11.2 集中趋势

11.3 离散趋势

……

第三篇 时间序列分析方法

《环保公益性行业科研专项经费项目系列丛书：R软件及其环境流行病学应用》的内容按由浅入深、循序渐进的顺序编排。全书内容包括三部分：第一部分为R基础，第二部分为常用统计方法，第三部分为时间序列分析方法。各部分的内容安排为：R基础包含R软件的安装、窗口的介绍和R的基本工作原理，R的数据运算和数据集操作，R的绘图和编程等。常用统计方法包括定量变量的描述性统计，分类变量的描述性统计，区间估计与假设检验（t检验，x2检验，单向和双向方差分析等），二项分布与泊松分布，生存率的计算和比较方法，线性回归与相关，Logistic回归，Cox比例风险模型等。时间序列分析方法包括时间序列的经典分析方法，平稳时间序列分析方法，非平稳时间序列分析方法，季节非平稳时间序列模型，带输入变量的时间序列模型和泊松分布广义加性模型，以及经济效应分析等。