环境基因组学实验指南

致谢

前言

Ⅰ基因表达谱分析

第一章高通量整体原位杂交检测环境干扰斑马鱼胚胎组织特异性基因表达改变

第二章荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应一种新的用于检测野生物种中由污染物引起的基因表达改变的差异显示方法

第三章cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因

第四章通过cDNA宏阵列和基因表达谱检测环境毒物的毒理效应

第五章cDNA文库的构建和筛选一在外界环境压力条件下，新表达基因的鉴定方法

第六章比较分子生理基因组学cDNA阵列的异种杂交

第七章以AtT20脑垂体细胞作为模型进行神经内分泌肽能系统干扰中的蛋白质组学分析

第八章应用蛋白质组学方法对海洋环境中过氧化物酶体增殖污染物进行风险评估

第九章应用1H-NMR波谱的环境代谢组学研究

Ⅱ检测全基因组突变

第十章限制性酶切标记基因组扫描检测基因突变

第十一章彗星实验在环境毒理学中的应用

第十二章微核实验在染色体水平检测DNA损伤

第十三章荧光素原位杂交探测环境毒物导致的染色体畸变和非整倍体

第十四章使用荧光原位杂交技术对人类和小鼠精子中染色体结构畸变探测的实验室方法

Ⅲ物种多样性的鉴定

第十五章DNA条形码的收集分析方案

第十六章应用抑制性消减杂交检测环境样品中元基因组多样性

第十七章16SRNA靶向变性梯度凝胶电泳指纹图谱分析微生物菌群

第十八章基于乳剂多聚酶链反应的分子单倍型分析方法

索引

图版

　　本书的目标是为希望使用基因组学回答环境问题的环境科学家提供一本手册。考虑到现有领域对完整环境基因组学研究的重要性，本书分为三个部分：基因表达谱分析；全基因组和染色体突变检测；在一个特定环境中对基因组多样性和多态性进行分析的方法。希望这些研究的综合能够降低环境风险评估的不确定性，并提供一个决定环境效应、保证人类健康和自然物种可持续性的系统化框架。　　随着后基因组时代的到来，生命科学已从针对单个基因、单一细胞或个体的研究向整合的系统生物学方向发展。推动这一发展的核心力量就是新的高通量分析技术，如基因组学、蛋白质组学、代谢组学等技术的出现。许多传统的学科在与这些新兴技术结合后，得到了飞速的发展。正是在这样一种新“革命”形势下，本书应运而出。本书以方法学为主，集中介绍了在机体对环境应答中基因表达谱、全基因组和染色体突变，以及基因组多样性和多态性三方面检测的新技术、新进展。　　本书对于从事环境科学、毒理学、生态学等相关学科的科研人员而言是一本极好的实验指南参考书。