1902年4月，鲁迅为了寻求救国救民的真理，到日本留学。1904年入仙台医学专门学校学医，想通过医学达到改造国家的目的。在此期间他结识了藤野先生，并与其建立了深厚的友谊。同时，鲁迅的思想也发生了巨大的转变，弃医从文，想从改变国民精神入手，挽救民族危亡。20年后，鲁迅在反动军阀和御用文人的迫害下，离开北京，来到厦门。《藤野先生》就是这时在厦门大学写的，作为对藤野先生永久的纪念。
