失了锐气，使城池防守单薄。"从熊廷弼接受命令到辽东，他的规划也是防守，与徐光启的想法非常吻合。只是因为朝廷没有确定的计划，议论纷纷，大臣中因为党派的意见相违背，阻止熊廷弼这样做的人很多。不久，沈阳、辽阳相继失守。徐光启请求赶快使用以前的方法，加固广宁的营寨。十一月，遵化失守，京城非常恐慌。徐光启应召到平台见皇上，说"我原来说的这件事，想不到它有的应验了。"急忙请求加高土堆的防御工事，妥善准备火器，派人拿着诏令四处奔走，招集散兵和逃亡的百姓。等到战事平息，徐光启请求朝廷把自己训练士兵、修整兵器的方略贯彻到底，但他的请求没能实施。

　　辛未年八月，明军兵败大凌河。徐光启上书万全的计策，说："用兵作战采取防守的策略，应先用步兵后用骑兵，军队应当聚集而不应该分散，应当精良而不应该庞杂。"徐光启陈述排兵布阵的方略非常详尽。但这些方略都没能实施。

　　徐光启性格宽厚仁爱，做事果断，不喜欢逢迎讨好，一生致力于有用的学问，完全拒绝各种不良的嗜好。他曾经说过："使国家富裕，一定要依靠农业；使国家强大，一定要依靠训练有素的军队。"主要意思都是以退为进。他说："这是先父'勇退'(勇于退让)的遗训。"因此他在权衡各种重大政事时，没有不根据这个的。